U.C. 0093, Char Aznable trở thành chỉ huy của quân đội Neo-Zeon và phát động cuộc chiến chống lại Liên Minh Trái Đất. Giờ đây chỉ có Amuro Ray, kình địch của Char, cùng Lực lượng đặc nhiệm London Bell có thể ngăn Char khiến tiểu hành tinh Axis rơi xuống Trái Đất.